Segura est un village situé dans la région du Goierri et ses communes voisines sont : Mutiloa au nord, Zegama au sud, Idiazabal à l'est et Zerain à l'ouest. L'ensemble forme la vallée d'Aizkorpe.
La municipalité a une superficie de 9,5 km2 et se situe à 240 mètres au-dessus du niveau de la mer.
Niché dans un paysage montagneux, Aizkorri (1528 m) et Txindoki (1346 m) sont les sommets les plus importants. Au niveau local, il faut souligner Santa Barbara (724 m) et Unamendi (786 m).
La distance entre Segura et les différentes capitales basques est la suivante : Donosti 53 km, Gasteiz 73 km, Iruña 76 km, Bilbo 96 km, Bayonne 105 km.
