Segura se localiza en la comarca del Goierri, y sus poblaciones vecinas son: Mutiloa al norte, Zegama al sur, Idiazabal al este y Zerain al oeste. Todas ellas forman el valle de Aizkorpe.
El municipio tiene una superficie de 9,5km2 y se sitúa a 240 metros sobrte el nivel del mar.
Enclavado en un paraje montañoso, el Aizkorri (1528m) y el Txindoki (1346m) son los picos más destacados. A nivel local destacan, Santa Barbara (724m) y Maudinamendi (786m).
La distancia desde Segura a las distintas capitales vascas es la siguiente: Donosti 53 km, Gasteiz 73 km, Iruña 76 km, Bilbo 96 km, Baiona 105 km.
